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企业根据国家有关政策规定，为在本企业任职或者受雇的全体员工支付的补充养老保险费、补充医疗保险费，分别在不超过职工工资总额5%标准内的部分，在计算应纳税所得额时准予扣除，超过的部分，不予扣除；第四，企业按照国家有关规定为特殊工种职工支付的法定人身安全保险费，例如企业为从事高空危险作业的职工购买意外伤害保险，允许税前扣除。第五，规定之外的商业保险支出不能税前扣除。这一点需要企业特别注意，因为现在不少效益好的企业都为员工上了各类商业保险，按照《实施条例》第三十六条的规定，除企业依照国家有关规定为特殊工种职工支付的其他人身安全保险费和国务院、税务主管部门规定可以扣除的其他商业保险外，企业为投资都或者职工支付的商业保险费，不得扣除。第六，企业按规定支付的财产保险费，准予扣除。同时注意，企业参加商业保险后，发生保险事故时，根据合同约定所获得的赔款，在计算应纳税所得额时，应抵扣相应财产损失。
2、住房公积金的列支
目前，我国存在着一些效益不好的企业经常拖欠职工的住房公积金，一些效益较好的单位则有意将一些应税福利，如将各类补贴、津贴打入“住房公积金”账户，并借此进行逃避税收的情况。对此，专家提醒企业，根据财政部、国家税务总局关于基本养老保险费基本医疗保险费失业保险费住房公积金有关个人所得税政策的通知》（财税[2006]10号）规定，以及《住房公积金管理条例》、《建设部、财政部、中国人民银行关于住房公积金管理若干具体问题的指导意见》（建金管[2005]5号）等文件精神，单位和个人分别在不超过职工本人上一年度月平均工资12%的幅度内，其实际缴存的住房公积金，允许在个人应纳税所得额中扣除。同时，对高收入行业及个人的缴存基数，被限制为不超过当地职工社会平均工资的3倍。在自查过程中，企业要特别注意不要超标列支。
3、私车公用补贴的列支
为了节约经营成本，不少企业存在租用员工车辆办公的情况。对此，专家提醒，虽然目前国家并未对此作出明确规定，但一般来说，私车公用是比照《国家税务总局关于企事业单位公务用车制度改革后相关费用税前扣除问题的批复》国税函[2007]305号）的规定来执行。按照该文件的规定，企事业单位公务用车制度改革后，在规定的标准内，为员工报销的油料费、过路费、停车费、洗车费、修理费、保险费等相关费用，以及以现金或实物形式发放的交通补贴，均属于企事业单位的工资薪金支出，应一律计入企事业单位的工资总额，按照现行的计税工资标准进行税前扣除。因此，企业因使用私人车辆而以现金、报销等形式向私人车主支付的相关费用，均应视为个人取得的公务用车补贴收入，企业应依法代扣代缴个人所得税。如果是本企业职工的，按照“工资、薪金所得”项目计征个人所得税，如果是非企业人员的，则按照“劳务报酬所得”计征个人所得税。如企业不履行代扣代缴义务，企业*6可被处3倍的罚款。
但需要指出的是，目前不少地方也出台了相关的规定，企业如果在自查中发现类似问题，应及时和当地主管税务门进行沟通。比如，《北京市地方税务局关于明确若干企业所得税业务政策问题的通知》（京地税企[2003]646号）第三条就规定，对纳税人因工作需要租用个人汽车，按照租赁合同或协议支付的租金，在取得真实、合法、有效凭证的基础上，允许税前扣除；对在租赁期内汽车使用所发生的汽油费、过路过桥费和停车费，在取得真实、合法、有效凭证的基础上，允许税前扣除。其它应由个人负担的汽车费用，如车辆保险费、维修费等，不得在企业所得税税前扣除。
4、差旅费的列支
《企业所得税法》对成本费用支出作了原则性规定，但并未对差旅费的开支范围、开支标准进行具体明确。然而，专家提醒，没出台文件，并不意味着企业就可以从中投机。因为与其他费用一样，税务机关在掌握税前扣除的问题上，依然是实质重于形式。也就是说，税务机关核查企业的差旅费时，都会要求提供相关的证明资料和合法凭证，否则，是不会允许在税前扣除的。差旅费的证明材料主要应包括：出差人员姓名、地点、时间、任务、支付凭证等。
此外，差旅费的个税问题也需要引起注意。按照《财政部国家税务总局关于个人所得税工资薪金所得减除费用标准有关政策问题的通知》财税[2005]183号第二条的规定：“工资、薪金所得应根据国家税法统一规定，严格按照‘工资、薪金、奖金、年终加薪、劳动分红、津贴、补贴以及与任职或者受雇有关的其他所得’的政策口径掌握执行。除国家统一规定减免税项目外，工资、薪金所得范围内的全部收入，应一律照章征税。
关于差旅费的开支标准，新的《企业财务通则》也无具体规定。各地的标准也不尽相同，但是，都必须有真实合法的票据，非个人性质的支出，并且在当地规定的标准以内，才允许在税前扣除。
最后，专家还提醒，企业自查查出问题后，不要存在侥幸心理，把“问题账”继续作下去。因为，为了达到强化个人所得税的征收管理和规范工资薪金支出的税前扣除的双重目的，国家税务总局在前不久刚刚出台了《国家税务总局关于加强个人工资薪金所得与企业的工资费用支出比对问题的通知》（国税函[2009]259号）。该文件的实质就是要加强对个人工资薪金的监管。此外，国家税务总局在《国家税务总局关于加强税种征管促进堵漏增收的若干意见》（国税发[2009]85号）中也特别要求：国税局、地税局要加强协作，对企业所得税申报表中的工资薪金支出总额和已代扣代缴个人所得税工资薪金所得总额进行比对。对二者差异较大的，地税局要进行实地核查或检查，对应扣未扣税款的，应依法处理。2009年度比对范围不得低于企业所得税汇算清缴总户数的10%。
企业自查风险提示三：吃透"三项费用"列支的政策细节
会计处理上将职工工会经费、职工福利费和职工教育经费称为“三项费用”。作为一项企业日常管理的常规支出，在新的《企业所得税法》（以下简称“新税法”）实施后，“三项费用”的税前扣除政策也有很大的变化。因此，专家提示企业，在自查过程中，不要忽视此类常规的费用列支，特别要关注政策规定中的细节问题。
职工工会经费：准确理解扣除基数—“工资总额”
据介绍，工会经费是指工会依法取得并开展正常活动所需的费用。按《中华人民共和国工会法》的规定，工会经费的主要来源是工会会员缴纳的会费和按每月全部职工工资总额的2％向工会拨缴的经费，其中2％的工会经费是经费的最主要来源。专家表示，工会经费看似简单，但在实际工作中却经常有企业在该项费用的列支上“阴沟翻船”。原因是企业没有准确把握相关的税收政策规定，被查出之后，往往不得不对已计入损益中的工会费用作纳税调整，并向税务机关补缴税款。
专家解释称，按照新《企业所得税法实施条例》（以下简称“新条例”）第四十一条的规定，企业拨缴的工会经费，不超过工资、薪金总额2%的部分，准予扣除。这里需要提醒企业，新税法实施后，“工资、薪金总额”的标准有很大变化。
按照1989年国家统计局第1号令《关于职工工资总额组成的规定》的规定，工资总额分为六个部分，即，计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资和特殊情况下支付的工资。工资、薪金总额是计算工会经费的基数。其总额的确定，依据新条例第三十四条规定，企业发生的合理的工资、薪金支出，准予扣除。前款
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