对被查单位发票的检查工作内容主要有两方面：一是鉴别发票的真伪;二是核实发票所载明业务的真伪。对发票所反映业务是否真实的判定，检查人员要通过查阅相关合同、协议，查找资金流向、货物流向，到对方单位核实等方法进行落实。
　　一般来说，收取发票的违法行为主要有三种：真票假业务——发票是真的，但业务是虚构的;假票假业务——不仅发票是假的，连业务也是虚构的;假票真业务——发票是假的，但业务却是真实的，这种情况下，假发票往往为“善意”取得。
　　很多企业为了减少员工的个人所得税负担，通过为员工报销发票的方式支付部分工资报酬，由于员工没办法提供数量较多的消费发票，只能“另辟蹊径”从票贩子手里购买假发票。这些发票零散、种类多，往往不能完整地反映一项业务，并且和真发票、真业务混在一起，鉴别工作量较大，有一定的普遍性，检查人员在检查时，不应轻易放过。
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