财政总预算会计年终结账是指会计年度终了时，对年终结清和结算中发生的会计事项进行结账。
一般分为年终转账、结清旧账、记入新账：
(1)年终转账。计算出各账户12月份合计数和全年累计数，结出12月末余额，编制结账前的“资产负债表”。再将应对冲转账的各个收入、支出账户余额，填制12月份的记账凭证(凭证按12月份连续编号，填制实际处理日期)分别转入“预算结余”、“基金预算结余”和“专用基金结余”科目冲销。将当年“财政周转金支出”转入“财政周转金收入”科目冲销，并将财政周转金收支相抵后的余额转入“财政周转基金”。
(2)结清旧账。将各个收入和支出账户的借方、贷方结出全年总计数，然后在下面划双红线，表示本账户全部结清。对年终有余额的账户，在“摘要”栏内注明“结转下年”字样，表示转入新账。
(3)记入新账。根据本年度各个总账账户和明细账户年终转账后的余额编制年终决算“资产负债表”和有关明细表(不编记账凭证)，将表列各账户的余额直接记入新年度有关总账和明细账各账户预留空行的余额栏内，并在“摘要”栏注明“上年结转”字样，以区别新年度发生数。决算经本级人民代表大会常务委员会(或人民代表大会)审查批准后，如需更正原报决算草案收入、支出数字时，则要相应调整旧账，重新办理结账和记入新账。
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