商品流通企业会计核算的方法有采购成本核算、销售成本的核算及商品流通费用的核算。
1、采购成本核算，是指对于采购过程中发生的物资毁损、短缺等，除合理的损耗作为商品的“其他可归属于商品采购成本的费用”计入采购成本外，应区别不同情况进行会计处理：
(1)应从购货单位、外部运输机构等收回的物资短缺或其他赔款，冲减物资的采购成本；
(2)因遭受意外灾害发生的损失和尚待查明原因的途中损耗，不得增加物资的采购成本，应暂作为待处理财产损溢进行核算，在查明原因后再作处理。
2、销售成本的核算，通常情况下，企业应按从购货方已收或应收的合同或协议价款确定销售商品的收入金额。
3、商品流通的核算，按照商品具有使用价值和价值两种属性的理论，商品核算应该既要反映商品的使用价值，又要反映商品的价值。反映商品的使用价值，要对商品分类进行实物数量核算，反映各种商品数量进、销、存增减变化情况；反映商品的价值，要以货币为计量单位，反映商品进、销、存金额的增减变化情况。商品的数量核算和金额核算是互相联系的。
(1)采用数量进价金额核算法核算
这是以实物数量和进价金额两种计量单位，反映商品进、销、存情况的一种方法。主要内容包括：
①“库存商品”的总分类账和明细分类账统一按进价记账。总分类账反映库存商品进价总值；明细分类账反映各种商品的实物数量和进价金额；
②“库存商品”明细分类账按商品的编号、品名、规格、等级分户，按商品收、付、存分栏记载数量和金额，数量要求永续盘存。
(2)采用数量售价金额核算法核算
这是以实物数量和售价金额两种计量单位，反映商品进、销、存情况的一种方法。主要内容包括：
①“库存商品”的总分类账和明细分类账统一按售价记账；
②设置“商品进销差价”账户，记载售价金额和进价金额之间的差额，定期分摊已销商品进销差价，计算已销商品进价成本和结存商品的进价金额。
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