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事业单位的固定资产也有对应的非流动资产基金。为满足预算管理的需要，事业单位固定资产的核算一般采用双分录的形式。购置固定资产的支出，在实际支付购买价款时确认为当期支出或减少专用基金中的修购基金，同时增加固定资产原值和非流动资产基金。在计提折旧时，逐期减少固定资产对应的非流动资产基金。处置固定资产时，相应减少非流动资产基金。
(一)固定资产的取得
事业单位取得固定资产时，应当按照其实际成本入账。购入的固定资产，其成本包括购买价款、相关税费以及固定资产交付使用前所发生的可归属于该项资产的运输费、装卸费、安装调试费和专业人员服务费等。固定资产增加时，应当相应增加非流动资产基金，按照确定的固定资产成本，借记“固定资产”科目，贷记“非流动资产基金--固定资产”科目;同时，按照实际支付金额，借记“事业支出”、“经营支出”、“专用基金--修购基金”等科目，贷记“财政补助收入”、“零余额账户用款额度”、“银行存款”等科目。
1.购入固定资产扣留质量保证金的会计处理
借：固定资产(按照确定的成本)
贷：非流动资产基金--固定资产
(1)如取得固定资产全款发票
借：事业支出(构成资产成本的全部支出金额)
贷：财政补助收入、零余额账户用款额度、银行存款(按照实际支付金额)
其他应付款或长期应付款(扣留的质量保证金)
质保期满支付质量保证金时
借：其他应付款或长期应付款(扣留的质量保证金)
贷：财政补助收入、零余额账户用款额度、银行存款
(2)取得的发票金额不包括质量保证金的
借：事业支出等(不包括质量保证金的支出金额)
贷：财政补助收入、零余额账户用款额度、银行存款等
质保期满支付质量保证金时
借：事业支出等(实际支付的金额)
贷：财政补助收入、零余额账户用款额度、银行存款
2.融资租入固定资产的会计处理
事业单位以融资租赁租入的固定资产，其成本按照租赁协议或者合同确定的租赁价款、相关税费以及固定资产交付使用前所发生的可归属于该项资产的运输费、途中保险费、安装调试费等确定。
借：固定资产
贷：长期应付款(按照租赁协议或者合同确定的租赁价款)
非流动资产基金--固定资产(差额)
借：事业支出、经营支出等(实际支付的相关税费、运输费、途中保险费、安装调试费等)
贷：财政补助收入、零余额账户用款额度、银行存款等
定期支付租金时，按照支付的租金余额
借：事业支出、经营支出等
贷：财政补助收入、零余额账户用款额度、银行存款
同时，
借：长期应付款
贷：非流动资产基金--固定资产
(二)计提固定资产折旧
事业单位应当按照《事业单位财务规则》或相关财务制度规定确定是否对固定资产计提折旧，对固定资产计提折旧时，应当按月计提，按照实际计算金额，借记“非流动资产基金--固定资产”科目，贷记“累计折旧”科目。
(三)固定资产的处置
1.固定资产转入待处置资产时：
借：待处置资产损溢
累计折旧
贷：固定资产
2.固定资产报经批准予以处置时：
借：非流动资产基金--固定资产
贷：待处置资产损溢
3.发生清理费用时：
借：待处置资产损溢
贷：银行存款
4.收到残料变价收入时：
借：银行存款
贷：待处置资产损溢
5.结转固定资产处置净收入：
借：待处置资产损溢
贷：应缴国库款
