信息系统与企业组织结构的关系已经变得越来越广泛和深入。
　　一方面，传统组织结构在信息系统的支持下可以进行一些良性调整;
　　另一方面，信息系统也带来了一些新的协调手段，使得一些新型的组织结构在现实中成为可能。
　　信息系统对组织结构变革的影响具体表现为以下几个方面：
　　(1)支持组织扁平化调整。组织扁平化就是减少管理的层次，扩大管理的幅度。扁平化是通过赋予低层员工有制定决策和解决问题的权力(也称为授权)，而无须等待中层管理者批准的组织结构调整。扁平化的组织结构具有更好的灵活性和更快的反应能力，能够降低成本、提高产品和服务的质量，更能适应当前动态的全球经济。
　　组织扁平化时，信息系统成为很关键的要素。一方面，相应的管理层级变少，授权后的员工在信息系统支持下进行决策。另一方面，基于信息技术的支持，强化组织内部通信、监控协调能力，控制跨度可以得到显著的扩大。
　　(2)支持新型组织结构。在信息技术的支持下，一些组织设计并采用了一些新型的组织结构以增强组织竞争力，其中最为重要的是团队结构和虚拟组织。
　　①团队结构。团队，乃由一群不同背景，不同技能及不同知识的人员所组成，通常人数不多。他们分别选自组织中的不同部门，那是他们各人的“家”。组成团队后，他们共为某一特殊的任务而工作。
　　团队结构的特点：
　　①打破部门界限，并把决策权下放到团队成员，要求成员既全又专，团队负责活动的全部责任。
　　②团队组织适合于组织中具有特定的期限和工作绩效标准的某些重要任务，或者任务是独特、不常见的，需要跨职能界限的专门技能。
　　③团队作为对官僚结构的补充，既提高了标准化的效率，又增强了灵活性，是一种自我管理的团队。
　　信息技术使得团队之间的沟通和组织对团队的有效监督成为可能。
　　②虚拟织织。是一种区别于传统组织的一种以信息技术为支撑的人机一体化组织。其特征以现代通讯技术、信息存储技术、机器智能产品为依托，实现传统组织结构、职能及目标。在形式上，没有固定的地理空间，也没有时间限制。组织成员通过高度自律和高度的价值取向实现在团队的共同目标。
　　虚拟企业是企业伙伴间的一种联盟关系，是一些相互独立的企业(如供应商、客户、甚至竞争者)通过信息技术连接的暂时联盟，这些企业在诸如设计、制造、分销等领域分别为该联盟贡献出自己的核心能力，以实现技能共享和成本分担，其目的在于建立起某种特定产品或服务的世界一流竞争能力，把握快速变化的市场机遇，它既没有办公中心也没有组织结构图，可能还是无层级、无垂直一体化的组织。