以研究宏观经济学、制度经济学见长的樊纲，其创下的“中国市场化评估指数”在国内外反响很大。他一直在寻找各个制度构建之间的平衡点。他认为，具体到改革的问题上，就是在某一个阶段，改革的重大“瓶颈”在什么地方。如何消除这些瓶颈使得整个体系的效率得到改进，并且使整个改革得到推进。要防止出现冒进的情况，因为其他领域的改革需要一定的时间，这时候某个领域如果改得过于超前的话，也会出现混乱。一些发展中国家在亚洲金融危机的时候，一个重大的失误就是当其他制度都没有改，冒进地搞了资本市场的开放，结果导致了金融混乱。依此反思中国的问题，现在的瓶颈就是政府体制改革。计划经济的这些残余不改，其他领域里面的很多东西都改不动，这既是一个理论问题又是一个实践问题。
谈起转轨问题，樊纲称转轨特指20世纪末从计划经济向市场经济的转变过程，特点在于人类*9次从一个已经存在的制度向另一个已经知道的制度转轨，知道我要朝什么方向转轨。如果把改革的整个过程串起来看，其实中国也是在向一个已知的东西转轨，也许一开始比较模糊，后来才逐步清晰。转轨的另一个特征是在旧制度的既得利益关系约束下朝前改，后面一大堆利益约束着，于是就变通一个说法，打一个折扣。
回过头来想邓小平的那句话，“摸着石头过河”，其实过河是知道的，怎么过不知道，这恰恰是转轨经济学要研究的。所以这30年实际上我们都在研究这些事情，逐步实现这个转轨。
