山东省财政厅、山东省国家税务局、山东省地方税务局、中国人民银行济南分行印发《山东省跨市总分机构企业所得税分配及预算管理暂行办法》（鲁财预[2008]19号），实行“统一计算、两级预缴、汇总清算、分级管理”的税收征管和预算分配办法，共计六章三十六条，自2008年1月1日起执行。
《办法》所称跨市总分机构企业，是指总机构和分支机构均在山东省（含青岛市）境内，且跨市（指设区的市）设有不具备法人资格的营业机构的居民企业。主要内容包括：
税款预缴：《办法》指出，总分机构企业所得税按照本办法，实行按月或按季就地预缴。预缴方式一经确定，当年度不得变更。总机构统一计算的企业当期应纳税额，在每月或季度终了后10日内，按照总机构、二级分支机构应分摊的比例，在总机构、二级分支机构之间进行分摊，并通知到二级分支机构，同时报当地主管税务机关。总机构应将二级分支机构名单报主管税务机关备案。二级分支机构一经确定，当年不得变更。 总分机构分摊的预缴税款由总机构、二级分支机构就地办理缴库。
分摊税款比例：《办法》规定，总机构应按照以前年度（1-6月份按上上年度，7-12月份按上年度）总机构、分支机构的经营收入、职工工资和资产总额三个因素，计算总机构、各分支机构应分摊税款的比例，三因素的权重依次为0.35、0.35、0.30.《办法》强调，总机构应在每年1月底前、6月底前，将依照本办法确定的各分支机构当年上半年、下半年应分摊税款的比例，按照规定格式，报送总机构所在地主管税务机关，并下发各分支机构。新设立的分支机构，当年实现的企业所得税不就地预缴，由总机构统一汇缴；从第二年起，就地预缴企业所得税，并以上年三因素参与分摊；从第三年起，按本办法第十五条规定执行。撤销的分支机构，撤销当年剩余期限内应分摊的企业所得税款由总机构就地缴纳。
汇总清算：《办法》规定，总分机构企业所得税在年度终了后5个月内，由总机构负责汇算清缴。总机构所在地税务机关根据汇总计算的企业年度全部应纳税额，扣除总机构和境内各分支机构已预缴的税款，确定应补缴（退）税额。
《办法》提出，总分机构应补缴的企业所得税查补税款、滞纳金、罚款，在总分机构所在地就地入库，其中60%缴入中央国库，8%缴入省级国库，32%缴入市及市以下国库。办法实施后，缴纳和退还2007年及以前年度的企业所得税，仍按原办法执行。
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